اكتشف الباحثون فيروس شاموندا جديد في الماشية الفرنسية
بدأت التقارير في يونيو من قطعان الماشية في مقاطعات دوب وأين الفرنسية، وتبعتها في يوليو حلقات مماثلة في سافوا وهاوت-سافوا. شملت العلامات السريرية حمى قصيرة الأمد، وإسهال، واكتئاب أو فقدان الشهية، وانخفاضات كبيرة ولكن قابلة للعكس في إنتاج الحليب. تم تأكيد حلقات مماثلة لاحقًا في ألمانيا، سويسرا وهولندا.
أظهرت تحقيقات تسع قطعان متأثرة في البداية أن إنتاج الحليب بالكميات الكبيرة انخفض بنسبة تتراوح بين 15% و75%. تراوح نسبة الأبقار المصابة بالإسهال من 8% إلى 100% عبر القطعان، والتي تحتوي على عدد يتراوح بين 25 و275 حيوانًا. عادة ما استمرت حلقات الإسهال الفردية من يوم إلى ستة أيام. كانت اختبارات تستهدف فيروس شمالنبرغ، الذي تم النظر فيه خلال التحقيق الأولي، سلبية.
جمع الباحثون البلازما والمواد البرازية من 14 بقرة مصابة بأعراض في ثلاث مزارع في هاوت-سافوا. كانت الحيوانات قد طورت حمى أو اكتئاب خلال الـ 48 ساعة السابقة وما زالت تظهر علامات عند أخذ العينات. تم تجميع المواد في ثلاث مجموعات بلازما وثلاث مجموعات برازية قبل التحليل.
باستخدام تضخيم غير معتمد على التسلسل وتسلسل أكسفورد نانوبيور، وجد الفريق قراءات فيروس الأورثوبونيا في كل مجموعة بلازما، بلغ عددها حوالي 4700، 43500 و7500 على التوالي. ووجد أقل من 1000 قراءة في كل مجموعة برازية. أنتج التحليل تسلسلات ترميز كاملة لأجزاء L وM من جينوم الفيروس وجزء S جزئي مكون من 775 نيوكليوتيد. أسفر اختبار إضافي لخمسة قطعان في ثلاث مناطق فرنسية أخرى عن جينومين كاملين إضافيين.
تم البحث عن الفيروس لاحقًا في عينات من 33 قطيعًا متأثرًا تم جمعها بين 28 يوليو و11 أغسطس، بالإضافة إلى عينات الأجنة المجهضة من 18 قطيعًا إضافيًا تم جمعها بين 27 يوليو و11 أغسطس. اكتشفت كل من اختبار مجموعة سيمبو واسع النطاق واختبار تم تطويره خصيصًا لفيروس شاموندا الأوروبي RNA الفيروسي في كل عينة تم فحصها. في القطعان الـ 18 التي تم التحقيق فيها بشأن الإجهاضات، أبلغ المزارعون عن حمى واكتئاب في الأبقار قبل أسبوعين إلى أربعة أسابيع من الإجهاضات. تم العثور على RNA الفيروسي بشكل مستمر في المشيمات أو الأعضاء الجنينية، بما في ذلك الطحال والدماغ؛ كان نسيج الدماغ إيجابيًا في ستة أجنة.
وضع التحليل الجيني الفيروسات الفرنسية والألمانية في سلالة شاموندا منفصلة. كانت أجزاؤها L وM الأقرب إلى سلالة نيجيرية معزولة من الماشية في عام 1965، حيث تشترك بنسبة 93.02% و92.63% من التشابه النوكليوتيدي معها. تشاركت الفيروسات الفرنسية والألمانية 99.93% من التشابه في كلا الجزئين. كانت أجزاؤها S متطابقة مع بعضها البعض لكنها لم تتجمع مباشرة مع تسلسلات S النيجيرية. قال المؤلفون إن هذا النمط قد يعكس معدل طفرة عاليًا أو إعادة ترتيب، على الرغم من أن البيانات المتاحة لم تحدد متى أو أين أو في أي سلالة قد حدث مثل هذا الحدث.
صنف الباحثون الفيروس ضمن نوع Orthobunyavirus schmallenbergense بناءً على تشابه الأحماض الأمينية، بينما وصفوه بأنه سلالة شاموندا جديدة بسبب موقعه الجيني المميز. وقالوا إن الاكتشافات في فرنسا وألمانيا كانت أول تحديدات جزيئية تم الإبلاغ عنها لفيروس الأورثوبونيا الشاموندا في أوروبا. لا يوجد حاليًا أي دليل يظهر أن الفيروس يصيب البشر. دعت الدراسة إلى المزيد من المراقبة البيطرية والمخبرية، بما في ذلك التحقيق في ذباب القلي، والنتائج الإنجابية والعينات المؤرشفة.
